Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcbP68404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcbP68404 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcbP68404 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcbP68404 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcbP68404 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcbP68404 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms