Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actg1P63260 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg1P63260 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms