Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sumo1P63166 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms