Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspd1P63038 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspd1P63038 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms