Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps27aP62983 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps27aP62983 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps27aP62983 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms