Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2bP62915 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2bP62915 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2bP62915 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms