Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3P62908 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps3P62908 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms