Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ElobP62869 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElobP62869 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElobP62869 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ElobP62869 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ElobP62869 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ElobP62869 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ElobP62869 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ElobP62869 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ElobP62869 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElobP62869 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ElobP62869 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms