Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23P62830 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23P62830 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms