Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms