Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsnl1P62761 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms