Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps13P62301 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps13P62301 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps13P62301 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms