Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps29P62274 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms