Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snap25P60879 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms