Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3bP59470 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr3bP59470 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms