Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nphp4P59240 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms