Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcif1P59114 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcif1P59114 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms