Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csrnp1P59054 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csrnp1P59054 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrnp1P59054 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrnp1P59054 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms