Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdrg1P59048 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms