Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtnsP57757 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtnsP57757 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtnsP57757 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtnsP57757 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtnsP57757 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms