Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bace1P56818 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Bace1P56818 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bace1P56818 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bace1P56818 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bace1P56818 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms