Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp5P56399 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms