Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmp8bP55105 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bmp8bP55105 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp8bP55105 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms