Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtskP55097 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtskP55097 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtskP55097 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtskP55097 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtskP55097 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtskP55097 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtskP55097 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtskP55097 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtskP55097 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtskP55097 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms