Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp4P55088 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms