Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23bP54728 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms