Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms