Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fdft1P53798 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms