Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms