Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp10P52479 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp10P52479 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp10P52479 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp10P52479 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp10P52479 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp10P52479 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp10P52479 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp10P52479 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp10P52479 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms