Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ClgnP52194 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClgnP52194 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ClgnP52194 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ClgnP52194 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ClgnP52194 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms