Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApodP51910 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ApodP51910 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ApodP51910 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApodP51910 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ApodP51910 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ApodP51910 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ApodP51910 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApodP51910 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApodP51910 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApodP51910 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApodP51910 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApodP51910 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms