Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn1swP51491 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms