Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl9P51410 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl9P51410 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl9P51410 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms