Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FanccP50652 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FanccP50652 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FanccP50652 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FanccP50652 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FanccP50652 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FanccP50652 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FanccP50652 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FanccP50652 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FanccP50652 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FanccP50652 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FanccP50652 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanccP50652 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FanccP50652 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FanccP50652 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FanccP50652 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FanccP50652 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanccP50652 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanccP50652 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FanccP50652 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms