Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LtbrP50284 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbrP50284 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LtbrP50284 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms