Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BckdhaP50136 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BckdhaP50136 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms