Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfbP49766 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfbP49766 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms