Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp3P49194 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms