Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neurod6P48986 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Neurod6P48986 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod6P48986 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms