Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms