Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LmnaP48678 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LmnaP48678 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms