Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl11P48298 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl11P48298 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl11P48298 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms