Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl13P47963 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms