Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igfbp6P47880 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igfbp6P47880 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igfbp6P47880 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms