Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf4P43488 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms