Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Egr3P43300 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Egr3P43300 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Egr3P43300 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Egr3P43300 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Egr3P43300 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms