Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f2P43135 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms