Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3caP42337 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3caP42337 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms