Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elk1P41969 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Elk1P41969 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elk1P41969 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms